Sejarah Desa Kalibagor bermula dari pemukiman para leluhur yang memilih lokasi strategis ini karena kesuburan tanah dan ketersediaan sumber daya alam. Konon, nama "Kalibagor" berasal dari istilah lokal yang melambangkan kekayaan alam dan semangat juang para pendahulu.
Di masa lampau, masyarakat Desa Kalibagor hidup dengan nilai gotong royong yang kental, di mana setiap upacara adat dan ritual tradisional dijalankan untuk merayakan hasil panen serta menjaga keharmonisan antara manusia dan lingkungan. Tradisi lisan yang diwariskan dari generasi ke generasi telah mengokohkan identitas budaya desa ini.
Warisan sejarah tersebut terus dijaga dan dilestarikan, sehingga Desa Kalibagor tetap eksis sebagai simbol kekuatan budaya dan kemandirian dalam menghadapi tantangan zaman.